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Caratterizzano La Complessità del Trascrittoma Dei Mammiferi (in Italian)
Wu, Jiaqian
Synopsis "Caratterizzano La Complessità del Trascrittoma Dei Mammiferi (in Italian)"
Nella mia tesi di dottorato, ho descritto una pipeline di RT-PCR e clonazione su larga scala che ho sviluppato per ottenere diverse migliaia di cloni di cDNA di mammiferi (principalmente umani e topi) per la raccolta del gene NHGRI/NCI Mammalian Gene Collection. A quel tempo, gli strati della complessità del trascrittoma dei mammiferi non erano ancora completamente concepiti. In questo progetto, sono stato profondamente coinvolto in questioni strategiche e concettuali nella caratterizzazione della complessità del trascrittoma a diversi livelli. Utilizzando la pipeline RT-PCR combinata con algoritmi di previsione genica che utilizzano informazioni genomiche comparative, abbiamo identificato con successo e verificato sperimentalmente nuovi geni di mammiferi, come gli omologhi di ratti a lunghezza intera di geni di malattie umane. Inoltre, ho studiato la complessità del trascrittoma, compresi gli SNP e lo splicing alternativo in campioni di leucemia utilizzando la PCR quantitativa, e abbiamo sviluppato una tecnologia di analisi delle tracce per identificare più trascrizioni alternative di splicing in una singola reazione di sequenziamento. I miei risultati hanno suggerito che, in alternativa, le trascrizioni giuntate mostrano una regolazione specifica del tipo di cancro in salita o in discesa, e il rapporto di isoforme alternative giuntate può essere alla base del meccanismo del cancro.
