Свободная колония архей также обитает в мозге в качестве эндосимбиотической археи. Археи способны к магнитоперцепции и магнитотаксису. Митохондрия является протеобактерией и могла развиться из магнитотактической бактерии. Она имеет собственную бактериальную ДНК и может подвергаться делению и слиянию и образовывать колонию вне клетки. Мозг имеет внеклеточную митохондриальную сеть, которая является воспринимающей и магнитотактической и контролирует функции мозга. Скопления митохондрий наблюдаются в нервных окончаниях и играют важную роль в высвобождении нейротрансмиттера из пресинаптического нейрона. Сеть свободных митохондрий в мозге действует подобно колонии бактерий и контролирует функции мозга и нейротрансмиссию. Железо-серные центры и флавопротеины митохондрий способны к магнитоперцепции и делают митохондрии магнитотаксическими.